1) 非離子性親水性樣品和離子性親水性樣品
鹽溶液和緩沖液經常被用來作為流動相。典型的代表有以下幾種:
鹽溶液----氯化鈉水溶液、硝酸鈉水溶液、硫酸鈉水溶液、硫酸鈣水溶液、硫酸銨水溶液
緩沖液----磷酸緩沖液、三鹽酸緩沖液、醋酸緩沖液、檸檬酸緩沖液　添加鹽的濃度為0.05～0.3 M。
 

注意
(1) pH值范圍請控制在3.0~10.0。
(2) 如果流動相中含有氯離子，則流動相的pH請高于6。
(3) 可使用的溶劑最大鹽濃度為0.5 M。
(4) 不推薦使用硼酸緩沖液是因為填料中的基團會和硼酸發生反應。

2) 非離子性疏水性樣品和離子性疏水性樣品
為了抑制疏水性樣品的疏水性吸附，推薦在流動相中加入有機溶劑。另外，離子性的樣品還需添加鹽溶液。

注意
色譜柱中的流動相置換成含有機溶劑的流動相時，流速請控制在0.5 mL/min以下。
使用DMSO時，流速必須控制在0.3 mL/min以下并且色譜柱溫度必須高于50 ℃。

3) 蛋白質樣品
尿素和6M胍的水溶液可以作為蛋白質的變性劑而用作流動相。膜蛋白質這類的在水中溶解性很小的樣品，在溶劑中添加SDS或Brij-35等表面活性劑，效果很好。

注意
因為需要使用濃度較高的變性劑，如果色譜柱的溶劑頻繁更換，可能會縮短色譜柱壽命。所以，推薦使用專用的色譜柱。